苗族的主要信仰有自然崇拜、图腾崇拜、祖先崇拜等原始宗教形式，苗族传统社会迷信鬼神、盛行巫术。也有一些苗族信仰基督教、天主教。苗族信仰佛教、道教的极少。
传统地讲，苗族对一些巨形或奇形的自然物，往往认为是一种灵性的体现，因而对其顶礼膜拜，酒肉祭供。其中比较典型的自然崇拜物有巨石(怪石)、岩洞、大树、山林等。此外，苗族认为一些自然现象或自然物具有神性或鬼性，苗族语言往往鬼神不分，或者两词并用。
在一些苗族地区，人造物崇拜有土地菩萨、土地奶、家神、祭桥、水井等。土地菩萨苗语叫土地鬼，一般由几块石头垒成，土地屋多为木制或用三块石板搭成，极为简陋，设于寨旁路口处或大路边行人休息处。家神信仰存在于川黔滇方言的部分苗族中，即在家中设立“家神”偶像。祭桥流行于黔东南大部分地区。龙也是各地苗族的崇拜和祭祀对象。
大多数苗族人虔信巫术。主要的巫术活动有过阴、占卜、神明裁判、祭鬼等，此外还有蛊术等。巫术活动由巫师主持。巫师大多是非职业化的。他们在前述各种原生性崇拜和巫术活动中起着主持者的角色，有的地方巫师还兼任寨老。
巫师除了熟悉祭祀方法外，大多还能讲述本宗支的谱系、本民族重大历史事件和迁徙来源的路线，熟悉各种神话传说、古歌古词和民间故事，有的巫师还兼有歌师和舞师的职能。所以说，巫师是苗族传统文化的重要的传承人，在苗族社会中充任知识分子的角色。此外，巫师还掌握一定的医术，懂得一些草药，在为人驱鬼的同时，辅以科学的医药手段。
苗族的宗教属多神教。因崇巫信鬼，又称“巫教”或“巫鬼教”。苗族信奉和崇拜的鬼神甚多。苗族的宗教观念中，无论神和鬼，却都有善、恶之分。苗族的祭祀活动多由巫师主持。巫师，属职业宗教人物，在各苗族地区情况不一。
各地苗巫有一个共同的特点，即与一般僧道不同，他们同普通人一样，过着尘世间的生活，并且不脱离生产劳动。苗族最原始的宗教崇拜，是由“万物有灵”观念产生的自然崇拜。图腾崇拜也属一种原始的自然崇拜。苗族普遍盛行祖先崇拜，特别注重祭祖。这是“万物有灵”和“灵魂不灭”的原始宗教观念的引申和发展。
苗族最原始的宗教崇拜，是由“万物有灵”观念产生的自然崇拜。关于神鬼观念，显然都是从原始的自然崇拜演化来的。图腾崇拜也属一种原始的自然崇拜。苗族历史上的图腾崇拜，主要有如下几种：枫木崇拜、蝴蝶崇拜和盘瓠崇拜。苗族普遍盛行祖先崇拜，特别注重祭祖。这是“万物有灵”和“灵魂不灭”的原始宗教观念的引申和发展。
近代以来，基督教、天主教逐步传入苗族地区，并先后建立了一些苗族教会组织。川、黔、滇有部分苗族，开始信奉基督教和天主教。但直到建国前夕，信奉外来基督教和天主教的苗族群众，在整个苗族中还只是少数。
